徳川幕府が東蝦夷を平定するため
享和２年に函館奉行が寺院の設置を提案し
文化元年（１８０４）に寺院の設置が決まる。
寺院が建ったのは文化２年。
厚岸の国泰寺。
様似の等澎院。
有珠の善光寺。
これらは蝦夷三官寺と呼ばれている。

道内最古の仏舎利塔や日鑑記など
北海道の貴重な記録文書が所蔵されている。
境内にはエゾ山桜が多く
桜の名所としても有名です。